Фамилия Василишина — яркий пример того, как в русской ономастике женское имя становится основой для родового прозвания. Вопреки расхожему мнению, что большинство фамилий образовано от мужских имён, здесь мы видим обратный случай: в основе лежит просторечная форма имени Василиса — Василиша.

Имя Василиса пришло на Русь из Византии вместе с христианством. Греческое βασίλισσα (василисса) означает «царица», «царственная». Однако в народной среде полное имя сократили, добавив типичный славянский суффикс -ш-, который часто использовался для образования уменьшительно-ласкательных или обиходных форм (например, Агафья — Агаша, Мария — Мариша). Так появилась Василиша — не официальное, а бытовое, «домашнее» имя.

Дальше механизм простой: если главу семьи называли по матери или жене (а такое случалось, когда женщина была главной кормилицей или имела особый статус), то детей и домочадцев записывали как «Василишины дети». Со временем притяжательное прилагательное на -ин закрепилось в качестве фамилии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: чей? — Василишин, то есть потомок Василиши.

Важно заметить, что фамилия Василишина (женский вариант) и Василишин (мужской) — это одна и та же фамилия, меняющая окончание по роду носителя. Такая модель типична для восточнославянских фамилий, особенно распространённых в южных и центральных регионах России, а также на Украине.

Географически фамилия встречается нечасто, что говорит о её локальном происхождении. Вероятнее всего, родоначальником был незнатный крестьянин или посадский человек, а не дворянин — фамилии на -ин редко встречались в высших сословиях, где предпочитали -ов/-ев или -ский.

Точное место возникновения рода Василишиных сегодня можно установить только через архивные изыскания: метрические книги, ревизские сказки или писцовые книги. Но уже сейчас ясно: фамилия несёт в себе отпечаток народной языковой традиции, где официальное имя переплавилось в ласковое прозвище, а затем — в родовой знак.