Фамилия Васюнова — женская форма фамилии Васюнов, и её происхождение напрямую связано с именем Василий. В основе лежит просторечная форма Васюня (от Василий через уменьшительно-ласкательный суффикс -юн-). Такие формы были распространены в крестьянской и мещанской среде, где полное имя использовали реже, а в быту — свои, домашние варианты. Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Васюн- добавили суффикс -ов, означающий принадлежность («чей?» — Васюнов сын, внук).

Суффикс -юн- в именах встречается не так часто, как -я, -ка или -ша. Он придаёт оттенок ласкательности или, наоборот, некоторой простонародной фамильярности. В ономастике это маркер того, что фамилия могла закрепиться в среде, где ценили неофициальные, «домашние» прозвища. Васюня — не единственный пример: от той же модели пошли фамилии Кирюнов (от Кирилл), Мишунов (от Михаил), Петюнов (от Пётр). Все они — «братья» Васюнова по словообразованию, но каждая привязана к своему региону.

География фамилии Васюнов (и, соответственно, Васюнова) тяготеет к центральным и южным областям России, особенно к Воронежской, Тамбовской и Рязанской губерниям. В этих краях имя Василий было одним из самых популярных, а местные говоры охотно дробили его на множество уменьшительных форм. Если предки носительницы фамилии были из этих мест, то, скорее всего, они были крестьянами или однодворцами — людьми, которые не принадлежали к дворянству и часто носили фамилии, образованные от имён и прозвищ, а не от географических названий или профессий.

Спорных версий у этой фамилии почти нет. Корень прозрачен, суффикс типичен. Иногда встречается написание Васюнёва (с буквой ё), но это скорее графический вариант, не меняющий смысла. Важно не путать Васюнову с фамилией Васюков (от Васюк) — там суффикс -юк, характерный для украинской и белорусской традиции, а здесь чисто русская модель на -ов.