Фамилия Васюньков — один из тех редких случаев, когда за основу взята не полная, а уменьшительно-ласкательная форма имени, что сразу сужает круг возможных занятий предка. В основе лежит имя Васюня — народная, ласковая или просторечная форма канонического имени Василий. В русской ономастике суффикс -юня (-уня) характерен для домашних, фамильярных прозвищ: Васюня, Танюня, Дунюшка. Соответственно, Васюньков — это буквально «сын Васюни».

С точки зрения словообразовательной модели, перед нами типичная патронимическая фамилия на -ов. Суффикс -к- в основе (Васюньк-) не является редким, но указывает на то, что имя Васюня уже имело дополнительный уменьшительный суффикс -к- (Васюнька), а уже от него образовали фамилию. То есть полная цепочка: Василий → Васюня → Васюнька → Васюньков. Такая двойная уменьшительность — не редкость в крестьянской среде, где детей называли не по паспорту, а по-домашнему.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским регионам и Поволжью, где формы на -юня встречались чаще. В переписных книгах XVII века можно встретить крестьян с прозвищем Васюня, но сама фамилия Васюньков фиксируется не раньше середины XVIII века, что типично для позднего закрепления прозвищных форм в качестве наследственных. Сословно, скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия: в дворянских родословных книгах она не упоминается.

Любопытно, что фамилия Васюньков не имеет ничего общего с украинскими или белорусскими вариантами на -юк или -ёнок. Суффикс -ов однозначно указывает на великорусское происхождение. Также не стоит путать её с фамилией Васюков — та образована напрямую от Васюк (тоже уменьшительное от Василий, но с иным суффиксом). Васюньков — более редкий, «ласковый» вариант, который мог закрепиться за человеком с мягким характером или, напротив, иронично — за большим и суровым мужиком, которого в насмешку звали Васюнькой.

Итог прост: предок нынешних Васюньковых звался Васюней или Васюнькой, был русским крестьянином или посадским, а его фамилия — живое напоминание о том, что даже в официальной бумаге XVIII века могло сохраниться домашнее прозвище.