Фамилия Вершинены — одна из тех, что сразу указывает на место жительства предка. Её основа — слово «вершина», то есть верхняя, самая высокая точка чего-либо: горы, холма, оврага. Скорее всего, первый носитель фамилии, Вершина, жил на возвышенности, на верху села или у горной вершины. Такие прозвища давали людям по характерному признаку местности, где стоял их дом.

Словообразовательная модель здесь необычная. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые оканчиваются на -ов, -ев или -ин, Вершинены имеют окончание -ены. Это типичный вариант для фамилий, образованных от прозвища, оканчивающегося на -а, в родительном падеже множественного числа. По сути, это означает «из семьи Вершины» или «чьи? — Вершинины», но со временем ударение и произношение сместились, закрепив форму Вершинены. Такая модель встречается реже, но характерна для некоторых регионов России, особенно для северных и центральных говоров.

В ономастике фамилию относят к «топографическим» — тем, что образованы от названий объектов ландшафта. Аналогов много: Вершинин, Верховцев, Горский, Подгорный. Но Вершинены стоят особняком именно из-за суффикса. Если Вершинин — это «чей-то сын Вершины», то Вершинены — это «те самые, с вершины», целый род или семейство, что подчёркивает коллективную принадлежность.

Встречается фамилия в основном на Русском Севере и в Поволжье. В архивных записях XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Вершина, от которого и пошли Вершинины и Вершинены. Сословно фамилия не была аристократической: её носили в основном крестьяне, реже — купцы и мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Спорных версий происхождения немного. Иногда пытаются связать фамилию с глаголом «вершить» (решать, управлять), но это натяжка: прозвище Вершитель или Вершок существовали отдельно, а Вершина — это именно географический объект. Правдоподобнее всего — прямая связь с местом жительства.