Фамилия Вихрачевы — одна из тех русских фамилий, где за основу взяли не имя, а прозвище. У неё прозрачная этимология: корень «вихр» отсылает к слову «вихор». Вихры — это торчащие в разные стороны пряди волос, которые трудно пригладить. Поэтому прозвище Вихрач, скорее всего, дали человеку с непослушной, кудрявой или взлохмаченной шевелюрой. Так фамилия закрепила за потомками внешнюю примету предка — его волосы.

Менее вероятная, но тоже возможная версия связывает прозвище Вихрач со словом «вихрь». В этом случае прозвище носило бы не внешний, а характерологический оттенок: так могли назвать человека неуёмного, неугомонного, порывистого, «вихреподобного» в поведении. Поскольку обе версии опираются на одно и то же слово, но с разным значением, фамилия Вихрачев может указывать и на внешность, и на характер.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»). Вихрач — человек с вихрами, Вихрачев — его сын, потомок. Это типичная патронимическая модель для русских фамилий. Интересно, что сама основа «вихр» встречается и в других фамилиях: Вихров, Вихорев. Но Вихрачев выделяется суффиксом -ач, который в русских прозвищах часто придаёт слову оттенок носителя признака (ср. «бородач» — бородатый, «усач» — усатый). Вихрач — буквально «обладатель вихров».

О точном месте и времени возникновения фамилии Вихрачев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Однако можно предположить, что закрепилась она в центральных и северных регионах России, где были распространены прозвища на -ач. В официальных документах фамилия фиксируется с XIX века, но как прозвище могла бытовать на столетия раньше.