Фамилия Вилькос — одна из тех, где с первого взгляда неясно, славянская она или заимствованная. На слух она кажется польской или литовской, и это предположение ближе всего к истине. В основе фамилии лежит прозвище, образованное от литовского слова vilkas или польского wilk — «волк». Суффикс «-ос» в таком случае — это славянизированное окончание, характерное для фамилий на территории бывшего Великого княжества Литовского, особенно в белорусских и украинских землях. То есть Вилькос — это «волк» или «волчий», прозвище, которое давали человеку с соответствующими чертами характера: хитрому, одинокому, сильному или, наоборот, свирепому.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых говорах юго-западной Руси «вилька» означало развилку, раздвоение (сравните с русским «вилы»). Тогда прозвище Вилькос могло относиться к человеку, жившему на развилке дорог, либо имевшему какую-то физическую особенность (например, раздвоенный подбородок). Однако эта версия спорная: суффикс «-ос» для подобных прозвищ нетипичен, а вот для литовских заимствований — обычен.

Морфологически фамилия нестандартна: она не имеет привычного русского суффикса «-ов/-ев» или «-ин». Это говорит о том, что она закрепилась в документах в своей исходной, «голой» форме. Такое часто случалось с фамилиями польско-литовской шляхты или мещан, которые переселялись в Россию и сохраняли написание без адаптации. В XVIII–XIX веках носители фамилии Вилькос могли быть выходцами из Виленской или Гродненской губерний, где литовский и польский языки смешивались с белорусским.

Сравните с однокоренными фамилиями: Вильке, Вильковский, Вилькин. Вилькос стоит особняком — он короче и архаичнее. Если Вильковский явно указывает на дворянское происхождение (суффикс «-ский»), то Вилькос — скорее крестьянская или мещанская фамилия, записанная «как слышалась».

География фамилии сегодня размыта, но чаще всего она встречается в западных областях России и в Беларуси. Известных носителей с такой фамилией в истории нет, что тоже характерно: это фамилия простых людей, не попавших в энциклопедии. Её ценность — в прямом, почти зверином прозвище, которое предок носил пять-шесть поколений назад.