Фамилия Вишняков образована от прозвища Вишняк. В старину вишняком называли вишневую рощу, лесок или сад. Прозвище имело топографическое происхождение: так называли человека, жившего рядом с вишневым садом. В эпоху, когда не существовало точных адресов, такие именования помогали быстро найти нужного человека. Потомок человека с прозвищем Вишняк со временем получил фамилию Вишняков.

Необычно, что основа фамилии — это не название плода или дерева, а собирательное существительное, обозначающее целый массив. В ономастических работах, в частности у Б. Унбегауна, модели фамилий от топографических прозвищ рассматриваются как отдельная группа, указывающая на связь человека с местом. Вишняк в этом ряду стоит рядом с прозвищами вроде Дубняк, Березняк или Ольшаник.

Представители фамилии Вишняков упоминаются в Памятных книгах разных регионов. В Книгу памяти Курганской области внесен директор Малышевской неполной средней школы Каргапольского района Вишняков Аверкий Дмитриевич, родившийся в 1900 году в селе Пустуева. В Книге памяти Алтайского края записан Вишняков Василий Дмитриевич, а в Книге памяти Саратовской области — Вишняков Григорий Иванович (р. 1894), проживавший в селе М. Карай. Эта география показывает, что фамилия была распространена в разных губерниях, а не закрепилась в одной местности.

Среди известных однофамильцев — русский портретист Иван Вишняков (1699—1761), ученик Луи Каравакка. Он получил известность благодаря портретам и картинам на религиозные темы. Однако процесс формирования каждой конкретной фамилии мог быть длительным, и окончательно говорить о точном времени и месте её происхождения можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.