Фамилия Вологжин — это типичный пример «географического» прозвища, которое закрепилось за родом. Её основа — слово «вологжа»: так в старину называли жителя Вологды. В ходу были и другие варианты — воложанин, вологодчанин, вологодец, но именно форма «Вологжа» легла в основу фамилии с типичным русским суффиксом принадлежности -ин. Модель образования проста: прозвище Вологжа → «чей?» — Вологжин, то есть сын или потомок человека из Вологды.

Название самого города, известного с XIII века, вызывает споры. Самая ходовая версия связывает его со словом «волок» — местность, где перетаскивали суда между реками. Однако есть и финно-угорская гипотеза: на языках вепсов или коми «Вологда» могла означать «чистая вода», и город получил имя по реке. Обе версии имеют право на существование, и выбрать одну из них без новых данных сложно.

Говорить о точном времени возникновения фамилии Вологжин не приходится — процесс закрепления прозвищ за родами шёл несколько столетий. Ясно одно: предки носителей этой фамилии были выходцами с Русского Севера, из вологодских земель. В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, Вологжин сразу указывает на конкретную географическую точку, что делает её ценным источником для семейной истории.