Фамилия Выгнан образована от прозвища или нецерковного имени, которое давали ребёнку в крестьянской среде. Основа здесь — глагол «выгнать» (или «выгонять»), и прозвище могло быть связано с разными бытовыми ситуациями. Самый прямой смысл: «выгнанный» — то есть изгнанный, выдворенный откуда-то. Так могли назвать подкидыша, найдёныша или ребёнка, которого «выгнала» судьба — родившегося вне брака или оставленного родителями. В русских говорах «выгнанником» иногда называли человека, которого выгнали из общины или из дома, но в фамилии это могло закрепиться уже как охранительное имя: чтобы злые силы не тронули ребёнка, его нарочно называли «несчастным» или «отверженным».

Модель образования фамилии — типичная для восточных славян: усечённая основа глагола в форме причастия на -ан (-ян) плюс нулевое окончание. По такому же принципу возникли фамилии Кован, Ткач, Солтан, Плетён. В белорусской и украинской традиции такие бессуффиксные фамилии на -ан встречаются особенно часто, и Выгнан могла прийти оттуда. Географически фамилия редкая, встречается спорадически на западе России, в Беларуси и на Украине — в зоне активного бытования «выгонных» прозвищ.

Есть и менее очевидная версия: прозвище Выгнан могло относиться к пастуху или скотнику — человеку, который «выгонял» скотину в поле. В южнорусских и украинских говорах «выгон» — это пастбище, а «выгонщик» — пастух. Однако форма причастия (Выгнан, а не Выгонщик или Выгоняй) склоняет к первой, «изгнанной» версии. В любом случае, фамилия — не от христианского имени, а от бытового прозвища, что характерно для поздних крестьянских фамилий XVIII–XIX веков.