Фамилия Ягафарова образована от диалектного варианта мужского арабского имени Джагфар - Ягафар. В переводе на русский язык это имя означает «райский ручей, родник, река». Джагфар — это имя шестого имама, основателя мусульманской общины шиитов. К известным представителям данной фамилии относится Ягафаров Алик Каюмович (родился 21 февраля 1941 г. Юлдыбаево Башкирской АССР). Он окончил Томский политехнический институт, стал доктором геолого-минералогических наук; членом-корреспондентом РАЕН в 1996 году. В настоящее время Алик Каюмович является заместителем директора по научной работе Западно-Сибирского научно-исследовательского и проектно-конструкторского института технологии глубокого разведочного бурения. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ягафаровых можно лишь на основании генеалогических исследований.