Фамилия Якопов звучит как типичная русская патронимическая фамилия на -ов, но её основа выбивается из привычного ряда. Если бы она происходила от канонического имени Яков, мы бы имели дело с массовой фамилией Яковлев. Суффикс -ов здесь крепится к основе Якоп-, что указывает на иную, нецерковную форму имени.

Скорее всего, в основе лежит просторечная или диалектная форма имени Яков — Якоп. В русских говорах, особенно на северо-западе и в пограничных с белорусскими землями областях, звук «в» перед гласными мог переходить в «п» (явление, известное как спирантизация или оглушение). Так Яков превращался в Якоп. Фамилия Якопов, таким образом, означает «сын Якопа», то есть потомка человека, которого в быту звали не Яковом, а именно Якопом.

Интересно, что эта фамилия могла возникнуть и в среде, где смешивались русская и польская ономастические традиции. В польском языке имя Якуб (Jakub) в уменьшительной форме звучит как Якоп (Jakop). Если предок носителя фамилии был выходцем из Речи Посполитой или жил на этническом пограничье, его могли записать как Якоп, а его дети автоматически получали фамилию Якоповы.

Географически фамилия редкая и тяготеет к южным и западным регионам бывшей Российской империи — встречается в документах по Смоленской, Витебской и Могилёвской губерниям. В отличие от распространённых Яковлевых, носители фамилии Якопов, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где фамилии закрепились позже и с большими искажениями на слух.