Фамилия Яковцова — женская форма фамилии Яковцов, которая образована по довольно редкой для русских фамилий модели. Вместо привычного суффикса -ов (Яковлев) или реже встречающегося -цов здесь использован сложный суффикс -ов-ц-ов, что сразу выделяет фамилию среди однокоренных.

Основа фамилии — каноническое крестильное имя Иаков (в русской традиции Яков). В древнерусском языке от него образовывали уменьшительные формы: Яковец, Яковка, Якуш. Суффикс -ец в имени Яковец мог означать либо «маленький Яков» (сын, младший), либо, что вероятнее, служил прозвищем — «Яковец» как человек, принадлежащий к роду Якова или чем-то приметный. Затем от этого прозвища по стандартной модели образовали отчество-фамилию Яковцов (чей сын? — Яковцов), а уже от неё — женскую форму Яковцова.

В русской ономастике такая двойная суффиксация (-ов-ц-ов) встречается в основном в северных и сибирских говорах, где любили наращивать суффиксы для уточнения родства. Например, в архангельских и вологодских документах XVII–XVIII веков встречаются фамилии вроде Кузнецовцов, Петровцов — то есть «внук Кузнеца» или «потомок Петрова». Яковцова, скорее всего, из того же ряда: не просто «дочь Якова», а «дочь Яковца», то есть человека, которого в своё время прозвали Яковец.

Есть и вторая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от топонима — названия деревни Яковцево или Яковцово. Такие деревни есть в Костромской, Вологодской и Тверской областях. Тогда Яковцова — это «приезжая из Яковцева», но для женской фамилии такое объяснение работает хуже, так как топонимические фамилии обычно закреплялись за мужчинами.

В любом случае, фамилия Яковцова несёт в себе указание на имя предка, но с дополнительным оттенком: не просто «Яковлевна», а «внучка или потомок того, кого называли Яковец». Эта деталь — редкое свидетельство того, как в русской деревне ценили точность родственных связей, даже в прозвищах.