Фамилия Якунцева — женская форма фамилии Якунцев, и её происхождение напрямую связано с редким древнерусским именем Якун. В отличие от более привычных Яков и Яковлевых, Якун — это не уменьшительная форма, а самостоятельное имя, зафиксированное в новгородских берестяных грамотах XII века. Оно имеет скандинавские корни: от древнеисландского Hakun (Хакон), что означало «высокий род» или «родовитый». Через варяжские дружины имя попало в Новгород, где и прижилось, дав начало целому кусту фамилий.

Суффикс -цев указывает на модель образования, характерную для северных и центральных регионов России. Буквально Якунцев — «чей?» — сын или потомок Якуна. Форма Якунцева, соответственно, принадлежит женщине из этого рода. Интересно, что в некоторых говорах имя Якун могло смешиваться с прозвищем Якун (от «якать» — говорить с яканьем, или «якун» — бойкий говорун), но первая версия — от имени — подтверждается историческими документами.

Географически фамилия Якунцев встречается в основном в бывших новгородских землях — Новгородской, Псковской, Вологодской областях, а также в Сибири, куда новгородцы переселялись в XVI–XVII веках. Якунцевы могли быть как крестьянами, так и посадскими людьми, но в дворянские родословные книги эта фамилия, судя по всему, не попала — её носители оставались в среде свободных землепашцев и ремесленников.

Отдельного внимания заслуживает написание: в старых документах встречаются варианты Якунцов и Якунцев, что отражает колебания между суффиксами -ов и -ев в говорах. Но закрепилась именно форма с -ев, так как основа имени Якун заканчивается на твёрдый согласный, и по правилам русского языка фамилии от таких основ чаще получали суффикс -ов, но в северных диалектах нормой было -ев. Так что Якунцева — не ошибка, а живой диалектный след.