Фамилия Якущенко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Якущ. Имя Якущ является уменьшительной формой имени Яков (Иаков), которое переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Поэтому Якущенко буквально понималось как «сын Якущи».