Фамилия Яллаева — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано с тюркскими языками, а не со славянскими корнями. В основе фамилии лежит мужское личное имя Ялла (или Яллай), которое было распространено у народов Средней Азии, в частности у узбеков и таджиков. Само имя Ялла восходит к арабскому слову «аллах» (Бог), но в тюркской среде оно приобрело форму, близкую к междометию «я алла!» — возгласу, обращённому к Всевышнему. Таким образом, имя могло иметь значение «Боже мой» или «о, Аллах», что в доисламские времена могло быть частью имени-оберега или пожелания.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на согласный. Исходная форма — Яллаев, а окончание -а указывает на женский род, то есть Яллаева — это «жена или дочь Яллаева». В русской среде такие фамилии закрепились за представителями тюркских народов, которые входили в состав Российской империи или Советского Союза, особенно из Узбекистана, Таджикистана и Туркменистана.

Географически фамилия почти не встречается за пределами Средней Азии и тех регионов России, куда мигрировали выходцы оттуда. В дореволюционных метрических книгах она практически не фиксируется, что говорит о её относительно позднем закреплении — в советское время, когда проводилась массовая паспортизация и фамилии давались по отцу. Интересно, что в русском языке ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Ялла́ева, хотя в тюркском произношении ударение может быть на первом.

С точки зрения словообразования, это типичная патронимическая фамилия: её носители — потомки человека по имени Ялла. Прозвищного или профессионального значения у неё нет, она чисто именная. Встречается также вариант Яллаев (без конечного -а), но он менее распространён. Если искать аналоги, то можно вспомнить фамилии Аллаев или Аллабердиев — они построены по той же модели, но с другим суффиксом или основой.