Фамилия Ялунин образована от прозвища или нецерковного имени Ялуня. Основа здесь — корень «ял-», который в русских говорах имел несколько значений. В архангельских и вологодских диалектах «яла» — это крикунья, сварливая женщина, а «ялить» означало кричать, шуметь, браниться. В сибирских говорах «ялун» — это бык-производитель, а в переносном смысле — упрямый, своенравный человек. Таким образом, Ялуней могли прозвать либо человека с громким голосом и вздорным характером, либо, наоборот, крепкого и стойкого мужчину.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Ялунин, то есть сын или потомок Ялуни. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин особенно распространены. Встречаются однокоренные фамилии: Ялунов (с суффиксом -ов, более характерным для юга) и Ялутин (с другим уменьшительным суффиксом).

Географически фамилия Ялунин тяготеет к Вятке и Пермскому краю — именно там чаще всего фиксировались носители этой фамилии в документах XIX века. Это косвенно подтверждает связь с диалектным словом: в вятских говорах «яла» — бранное слово для шумной женщины, а «ялун» — озорник, проказник. Встречается фамилия и в Зауралье, куда переселенцы с Вятки уходили в XVII–XVIII веках.

Интересная деталь: фамилия Ялунин могла возникнуть и от другого корня — от тюркского имени Ялун (в переводе «молния»). В XVI–XVII веках в русских землях служили татарские мурзы и казаки, чьи имена иногда переходили в прозвища. Однако эта версия менее вероятна для крестьянских фамилий Вятки — скорее, мы имеем дело с исконно славянским прозвищем по характеру.