Именования, образованные по той же модели, что и фамилия Яндушкин, широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян. Славянские фамилии возникали от личного прозвища или от имени (христианского или языческого). Фамилия Яндушкин образована от уменьшительной формы чувашского имени Яндуш - Яндушка, которое, скорее всего, восходит к тюркскому слову «янды». На русский язык оно переводится как «победитель». Таким образом, потомок человека, которого звали Яндушка, со временем получил фамилию Яндушкин.