Фамилия Яшуткин происходит от имени Яков (церковная форма — Иаков). Оно имело ряд производных просторечных форм, одна из которых — Яшутка — и легла в основу данной фамилии. Имя Иаков переводится с древнееврейского как "второй по рождению". Таким образом, потомок человека, обладающего именем Яшутка, со временем получил фамилию Яшуткин.