Фамилия Яшутина — женская форма от Яшутин, и её разумнее начинать с мужского варианта. В основе лежит имя Яша — народная, разговорная форма канонического имени Иаков (в русской традиции — Яков). Суффикс -ин прямо указывает на принадлежность: Яшутин буквально означало «сын Яши» или «человек из дома Яши». Модель образования типична для северных и центральных областей России, где притяжательные фамилии на -ин широко распространены.

Однако у фамилии есть особенность, которая отличает её от множества «Яковлевых» и «Яшиных». Форма Яшутин содержит суффикс -ут-, который в русской антропонимии нередко придавал имени оттенок ласкательности или, наоборот, пренебрежительности, в зависимости от контекста. В ономастических работах, например у Б. Унбегауна, отмечается, что суффиксы -ут-, -юта, -ута характерны для прозвищ и уменьшительных форм в новгородских и псковских говорах. То есть Яшута — это не просто Яша, а Яша с особым, возможно, шутливым или фамильярным оттенком. Таким образом, фамилия Яшутин может указывать на происхождение из северо-западных земель Руси, где такие словообразовательные модели были в ходу.

Вторая, менее вероятная версия связывает основу с диалектным глаголом «яшутиться» — в некоторых говорах это означало «ёжиться, жаться от холода». Если прозвище Яшута дали человеку зябкому, вечно кутающемуся, то фамилия отражает не имя, а внешнюю черту. Но эта гипотеза слабее: в письменных источниках (например, в актах XV–XVII веков, собранных С. Веселовским) фамилии на -утин чаще встречаются именно от личных имён, а не от глаголов.

Социальный состав носителей был пёстрым. Яшутины могли быть и крестьянами, и посадскими людьми, и служилыми. В переписных книгах XVII века по Вятке и Перми Великой встречаются отдельные записи о крестьянах с такой фамилией, что подтверждает её «низовое» происхождение — без дворянского корня. В современных справочниках фамилия редкая, не входит даже в первую тысячу по частотности, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: круг возможных предков сужается до конкретных регионов, в первую очередь — север и северо-запад России.