Фамилия Юккин — редкий случай, когда прозвище или имя, лёгшее в основу, почти наверняка не было славянским, а пришло из тюркской или финно-угорской среды. Искать в ней корень «юк» в значении «иго» или «ноша» (как в слове «ярмо») не стоит: это случайное созвучие. Гораздо вероятнее, что перед нами русифицированная форма тюркского имени Юкки (или Юкка) — уменьшительного от Юсуп (Иосиф) или Юнус (Иона). В татарской и башкирской среде такие сокращения были обычны, а при переселении в русские земли их записывали на слух, добавляя типичный русский суффикс принадлежности -ин.

Суффикс -ин указывает на прямое родство: Юккин — «сын Юкки» или «человек из семьи Юкки». Это одна из самых распространённых моделей русских фамилий (сравните: Пушкин, Ильин, Гагарин), но здесь она наложилась на нерусскую основу. Важно, что фамилия не закрепилась в центральных губерниях: её очаги — Поволжье, Приуралье, возможно, бывшая Казанская губерния, где тюркское и русское население веками жило рядом.

Вторая, менее вероятная версия связывает Юккина с карельским или вепсским именем Юкка (Йоханна, Иван). В этом случае фамилия могла возникнуть на северо-западе, в Олонецкой или Архангельской губерниях, где финно-угорские имена русифицировались по той же схеме. Однако географическая привязка здесь слабее: в метрических книгах XIX века Юккины чаще встречаются именно в татаро-башкирских селениях, чем в карельских.

Окончание -ин, а не -ов, тоже говорит в пользу тюркской версии. Фамилии на -ов обычно образовывали от основ, оканчивающихся на согласный (Иван → Иванов), а на -ин — от основ на -а, -я (Юкка → Юккин). Если бы предка звали Юкко (с конечным гласным), фамилия могла бы стать Юкков, но запись «Юккин» закрепила именно женскую или уменьшительную форму имени.

Таким образом, Юккин — это фамилия, возникшая на стыке культур: русский суффикс, тюркское (или финно-угорское) имя, регион — скорее всего, восток Европейской России. Владельцы фамилии, вероятно, были крестьянами или мещанами, а их предки носили имя Юкка, которое со временем стало фамильным прозвищем.