Фамилия Загнитко — украинская по происхождению, образована от прозвища Загнит. В её основе лежит глагол «загнити», то есть «прогнить, сгнить». Такое прозвище вряд ли было оскорбительным: скорее всего, его давали человеку, который жил в сырой, болотистой местности, где всё вокруг «загнивало». Прозвище Загнит указывало на характер местности, а не на личные качества.

Обратите внимание на суффикс -ко. В украинской ономастике это один из самых распространённых патронимических суффиксов, который заменяет русское -ов/-ев и белорусское -ович. Загнитко буквально означает «маленький Загнит» или «сын Загнита». Такая модель особенно характерна для центральных и восточных областей Украины — Полтавщины, Черкащины, Киевщины.

Со временем прозвище Загнит, первоначально бытовавшее в устной речи, закрепилось в документах уже в форме Загнитко — как наследственное семейное имя. Судя по словообразованию, фамилия могла возникнуть не раньше XVI–XVII веков, когда на украинских землях активно шёл процесс оформления фамилий по патронимическому типу.

Редкость фамилии в том, что она сохранила прозрачную внутреннюю форму, почти не изменившись за несколько столетий. В отличие от многих украинских фамилий на -ко, которые со временем русифицировались (например, Шевченко осталось без изменений, а вот Гриценко могло превратиться в Гриценков), Загнитко не приобрело русских суффиксов и осталось в исходном виде. Это говорит о том, что носители фамилии либо долго жили в украинской языковой среде, либо переселились в другие регионы уже после того, как фамилия окончательно закрепилась.