Фамилия Захарчишен — редкий пример того, как распространённое каноническое имя обрастает неочевидными суффиксами. В основе лежит имя Захар (церковное Захария, от древнееврейского «вспомнил Господь»). Но если большинство фамилий на Захар- оканчиваются на -ов, -ин или -енко, то здесь мы видим суффиксальную цепочку -чиш-ен. Это указывает на западнорусское или украинско-белорусское происхождение.

Суффикс -ен в фамилиях типа Захарчишен — это не уменьшительная форма, а указание на принадлежность: «чей?» — Захарчишен, то есть сын или потомок Захарчиша. А само имя Захарчиш — это разговорная, обиходная форма имени Захар, образованная с помощью суффикса -иш, который в восточнославянских говорах мог придавать оттенок просторечия или даже пренебрежения (сравните: парниша, братишка). Впрочем, в фамилиях этот суффикс утратил эмоциональную окраску и закрепился как нейтральный.

Географически фамилия тяготеет к западным областям Украины (Волынь, Подолье) и югу Беларуси. В этих регионах суффикс -ен в патронимических фамилиях встречается чаще, чем в центральной России: Захарченко, Захарченя, Захарчишен — все они образованы по одной модели, но с разными диалектными окончаниями. Вариант на -шен указывает на твёрдый вариант основы (Захарчиш + ен), что типично для говоров, где смягчение согласных перед -ен не происходило.

Сословного барьера у фамилии не было: её могли получить и крестьяне, и мещане, и казаки. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предок носителя фамилии был человеком по имени Захар, а в быту его звали Захарчиш — так, как это было принято в его местности. Фамилия не перешла в разряд дворянских и не получила широкого распространения за пределами исторического ареала, поэтому сегодня она остаётся достаточно редкой.