Фамилия Замарахин произошла от прозвища Замараха. В его основе лежит глагол «замарать» — то есть «грязнить, пачкать» или «ославлять кого-либо». Чаще всего такое прозвище давали неряшливому, неопрятному человеку.

Но есть и другая версия. Замараха могло быть не прозвищем, а мирским именем-оберегом. В народе верили: назови ребенка Замараем — и нечистая сила не позарится на него, а мальчик вырастет красивым и здоровым. Такой обычай был распространён, и объяснение это не менее правдоподобно, чем первое.

Родственные именования встречаются в документах уже с XVI века: в 1568 году в Ярославле записан Замараев Андрей Степанович. Форма на -ин в фамилии Замарахин (от основы Замарах-) указывает на принадлежность конкретному человеку: «чей?» — сын Замарахи. Суффикс -ин характерен для русского севера и центральных областей, что тоже подтверждает раннее бытование фамилии именно в этих краях.

Таким образом, Замарахин — это потомок человека, которого в быту называли Замараха. Других версий, например, от названия местности или профессии, для этой фамилии нет — корень однозначно указывает на личное прозвище.