Фамилия Замарашкин — редкий случай, когда прозвище почти полностью сохранило свой исходный смысл и даже звучит так же, как звучало в повседневной речи несколько веков назад. Её основа — слово «замарашка». В русских говорах так называли не просто грязнулю или неопрятного человека, а того, кто постоянно пачкается в работе: печника, кузнеца, сапожника, маляра или трубочиста. То есть прозвище было не столько обидным, сколько профессионально-бытовым — им награждали за род занятий, а не за неряшливость.

Суффикс -ин указывает на типичную для северных и центральных областей России модель образования фамилий от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Замарашкин буквально означает «сын или потомок Замарашки». В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища встречаются довольно часто, но в фамилию они переходили редко — возможно, из-за кажущейся неблагозвучности. Тем интереснее, что Замарашкины сохранили её без изменений.

Есть и другая, менее вероятная версия: от диалектного слова «замарашка» в значении «растение, оставляющее следы на одежде» (например, лопух или череда). В этом случае прозвище могли дать сборщику трав или крестьянину, жившему у заросших сорняками полей. Но большинство ономастов склоняются к первой, «ремесленной» трактовке — она подтверждается тем, что в переписных книгах Тверской и Ярославской губерний фамилия Замарашкин встречается чаще всего в среде посадских людей и ремесленников.

Фамилия почти не имеет вариантов написания — в отличие от однокоренных Замараев или Замарин, где суффиксальная система сложнее. Географически Замарашкины тяготеют к Верхнему Поволжью, особенно к Костромской и Ивановской областям. В дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована — её носители были либо крестьянами, либо мещанами, что подтверждает бытовое происхождение прозвища.