Фамилия Замотины, как и многие русские фамилии, пошла от личного прозвища. В основе лежит прозвище Замота, а оно, в свою очередь, образовано от глагола «заматывать». Кого именно так называли? Тут возможны два совершенно разных варианта. Первый, самый прямой: человека, который профессионально занимался мотанием пряжи. Второй, переносный: так могли прозвать за характер — расточителя, гуляку или просто человека с запутанными, неясными делами (от «замотаться» в смысле «запутаться, устать, издергаться»). В народе слово «замота» имело ироничный оттенок, обозначая человека беспутного или суетливого.

Фамилия образована по стандартной и очень продуктивной модели: к основе на -а добавляется суффикс принадлежности -ин, указывающий на «сына Замоты» или «человека из рода Замоты». Такая модель (Замота → Замотин) характерна для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин так же распространены, как на юге — на -ов.

Самый известный носитель фамилии — литературовед Иван Иванович Замотин (1873-1942). Его научная биография показательна: до революции он занимался романтическими течениями в русской литературе XIX века (романтизм 1820-х годов, литература 1840-60-х). После 1917 года его труды («Семинарий по истории новой русской литературы», работы о Некрасове, этюды о Янке Купале и Якубе Коласе) уже написаны в русле формально-социологического метода, что отражает смену эпох и подходов в гуманитарной науке.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно — процесс шёл веками. Однако ясно, что это не случайное образование: прозвище Замота фиксируется в исторических документах, а значит, фамилия могла возникнуть ещё в XVI-XVII веках.