Фамилия Запороха — одна из тех, чей корень лежит на поверхности, но при ближайшем рассмотрении оказывается не таким однозначным. Чаще всего её связывают со словом «запорог» — то, что находится за порогом, или с глаголом «запороть» (зашить, заделать). Но есть и более яркая версия: в южнорусских и украинских говорах «запороха» или «запорожец» — это человек, живший за порогами Днепра. Прямая отсылка к Запорожской Сечи. Однако в данном случае фамилия образована не от этнонима, а от прозвища. Прозвище Запороха могли дать человеку, который жил на отшибе, за порогом села, или, наоборот, тому, кто постоянно «запирал» двери, был нелюдимым.

Модель образования фамилии — безсуффиксная, что для русской ономастики редкость. Обычно фамилии на -а, -о в именительном падеже (типа Шевченко, Гончар, Запороха) характерны для украинской традиции. В русском языке такие формы часто застывали в родительном падеже (Запорогов, Запорожин). Фамилия Запороха могла возникнуть как прозвище в единственном числе, которое затем не изменили, а оставили в исходном виде. Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был выходцем с юга, из малороссийских губерний, где подобные бессуффиксные фамилии были нормой.

Другая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию с профессиональной деятельностью. «Запороха» могли называть человека, который занимался починкой, «запоркой» чего-либо — например, портного или сапожника, который «запарывал» швы. Но эта версия уступает первой по убедительности: в русских говорах слово «запороха» в значении «ремесленник» не фиксируется.

Географически фамилия редкая. Встречается в основном на юге России и в восточных областях Украины, что подтверждает связь с запорожским регионом. В дореволюционных списках она не была массовой, что говорит о её локальном характере. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казачьей — вольные люди, жившие на границе Дикого поля.

В написании фамилии возможны варианты: через «о» (Запороха) и реже через «а» (Запараха), но последнее почти не встречается. Ударение, как правило, падает на второй слог: Запорóха.