Фамилия Запорова — женская форма фамилии Запоров, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Запор. Слово «запор» в русских говорах имело два основных значения. Первое, самое прямое — приспособление для запирания дверей, засов, задвижка. Второе, переносное — человек замкнутый, необщительный, «запертый» в себе, или, наоборот, упрямый, которого нужно «запирать», чтобы удержать. Скорее всего, прозвище Запор дали человеку с тяжелым, неподатливым характером.

Модель образования фамилии типична для русского Севера и центральных областей: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Запора). Форма Запорова — стандартная женская вариация, которая закрепилась в паспортной системе в XIX–XX веках. Встречаются и родственные фамилии: Запоркин, Запорцев, Запоренко, Запорский — они различаются суффиксами, но восходят к той же основе.

Есть и менее вероятная, но возможная версия: связь с украинским или южнорусским словом «запорожец» (житель Запорожья). В таком случае фамилия могла сократиться от Запорожский до Запоров. Однако эта гипотеза слабее, потому что для выходцев с Запорожья чаще образовывались фамилии на -енко, -ук или полная форма Запорожец. Прямое прозвище Запор встречается в документах XVII века, например, в переписных книгах Вятки и Устюга Великого, что подтверждает бытовое, а не географическое происхождение.

Сословно фамилия Запоров/Запорова не была дворянской. Её носители в основном крестьяне и посадские люди. В XIX веке фамилия фиксируется в Вологодской, Архангельской и Костромской губерниях — регионах, где слово «запор» в значении «засов» было особенно употребительно. Сегодня Запорова — редкая фамилия, её можно встретить в России и в русскоязычных общинах за рубежом, но массового распространения она не получила.