Фамилия Зайниев образована от личного имени Зайни — краткого, диалектного варианта арабского имени Зайнулла. Полное имя Зайнулла составное: первая часть восходит к арабскому «зайн» — «украшение», вторая — к «Аллах». В сумме имя означает «украшение Аллаха». Такие имена с корнем «зайн» (Зайнулла, Зайнетдин, Зайнуллин) характерны для тюрко-мусульманской среды, особенно среди башкир и татар. Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Зайни- добавился суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Зайниев, то есть сын Зайни). В документах фамилия зафиксирована в Башкортостане: Книга памяти республики упоминает Зайниева Саймета Зайниевича (1891 г. р., Мишкинский р-н, д. Ишимово), Зайниева Султангарея (1899 г. р., Калтасинский р-н, д. Старояшево) и Зайниева Шамидана (1886 г. р., Мишкинский р-н, д. Изимарино). Все эти записи относятся к началу XX века и к одним и тем же районам Башкирии, что указывает на локальное бытование фамилии среди местного татарского или башкирского населения. Интересно, что суффикс -ев здесь присоединён не к полной форме Зайнулла (как в фамилии Зайнуллин), а к сокращённой — Зайни. Это говорит о том, что в быту имя использовали в упрощённом варианте, а фамилия закрепилась именно от этой обиходной формы.