Фамилия Зениковы (в мужском варианте — Зеников) чаще всего ведет свою историю от уменьшительной формы крестильных имен Зенон или Зиновий. В основе лежит народное имя Зеня, а от него — Зеник, то есть «маленький Зеня» (с помощью уменьшительного суффикса -ик). Фамилия, таким образом, оказывается отчеством второго порядка: сын Зеника, внук Зени.

Имя Зенон в переводе с греческого означает «божественный», а Зиновий — «богоугодно живущий». Оба имени были в ходу в среде православного духовенства и среди крестьян, поэтому носители фамилии могли принадлежать к разным сословиям. Модель образования на -ов — самая распространенная в русском ономастиконе, что указывает на центральнорусское или поволжское происхождение рода.

Встречается вариант написания Зениковы — форма множественного числа, принятая для обозначения всего рода или семьи. В документах XIX века такая фамилия фиксируется в Тверской и Симбирской губерниях, что позволяет предположить очаг расселения в Верхневолжье и Среднем Поволжье. Точное место и время возникновения фамилии установить сложно, так как процесс закрепления отчеств в качестве фамилий растянулся на несколько столетий. Тем не менее, ясно, что фамилия Зениковы — не случайное прозвище, а устойчивое родовое имя, связанное с церковной традицией именования.