Фамилия Зенкин произошла от уменьшительной формы имени Зенон – Зенка. Согласно другой версии, фамилия образована от прозвища Зенка. Оно восходит к славянскому корню «зень», который имеет два значения: «глаз» (например, как в устаревшем слове «зеница» - «зрачок») и «пол, низ». Возможно, прозвище Зенка получил человек, отличавшийся зоркостью или же тот, кто жил в низине. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Зенон, со временем получил фамилию Зенкин.