Фамилия Зезина — это женская форма, а мужская, Зезин, образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от основы на согласный или -а/-я добавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Буквально «чей?» — Зезин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Зеза.

Корень «Зез-» неочевиден и относится к числу редких. Самая вероятная версия связывает его с диалектным глаголом «зезить» или «зезать» — в северных и сибирских говорах это означало «зевать, ротозейничать, смотреть по сторонам». Прозвище Зеза могли дать человеку рассеянному, невнимательному или, наоборот, любопытному, который постоянно высматривал что-то. В словаре Владимира Даля «зезя» — это «ротозей, разиня». Таким образом, фамилия Зезин — из прозвищ по характеру или поведению, типичных для крестьянской среды.

Есть и другая, менее распространённая версия: от уменьшительной формы канонического имени Зосима. В народном произношении Зосима часто превращалось в Зозулю, Зозу, а в некоторых говорах — в Зезю. Если это так, то фамилия Зезин — патроним, указывающий на предка по имени Зеза (из Зосимы). Однако эта гипотеза слабее, так как форма «Зеза» от Зосимы фиксируется редко, а глагол «зезить» и прозвище «Зеза» — вполне живые диалектные слова.

Географически фамилия Зезин (и Зезина) встречается нечасто, с заметной концентрацией в Вологодской и Архангельской областях, а также в Сибири — в регионах, куда переселялись северные крестьяне. Это косвенно подтверждает версию о северно-русском диалектном происхождении. В дореволюционных переписях Зезины числились в основном среди государственных крестьян и мещан, то есть не были ни дворянами, ни духовенством.

В написании фамилия устойчива: вариант Зёзин (с буквой «ё») встречается, но крайне редко и, скорее всего, является искажением при записи или местным произношением. Сравните с однокоренными фамилиями Зезюкин, Зезюлин — все они отходят от того же корня «зез-» со значением «ротозей».