Фамилия Жакина образована от прозвища Жака, и у этого прозвища есть как минимум три разных объяснения. Первое и самое распространённое толкование отсылает к диалектному слову «жака» — в старину так называли прижималу, притеснителя. То есть предок мог получить такое прозвище за напористый и настырный характер. Второе значение связано с учебой и пением: на Украине жаком называли бурсака или певчего, а в смоленских говорах — ученика, студента. Здесь прозвище уже указывает не на характер, а на род занятий. Третья версия выводит прозвище из украинского глагола «жакувати», означавшего мошенничать или плутовать, — в таком случае Жакой могли назвать нечестного человека.

Фамилия построена по типичной для русских фамилий модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: Жакина буквально значит «дочь или жена Жаки». Такая форма характерна для фамилий, образованных от слов или прозвищ, оканчивающихся на -а. С точки зрения географии, фамилия встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также на Украине, что совпадает с ареалом бытования тех самых диалектных слов «жака» и «жак».

Из всех версий наиболее правдоподобной выглядит первая — от «жаки» в значении «притеснитель». Она подкреплена словарными данными и встречается в ономастических работах по русским прозвищам. Версия про ученика-бурсака более узкая и региональная, а про мошенника — наименее документированная.