Фамилия Жайворонко происходит от украинского слова «жайворон» — так называют полевую птичку жаворонка. Это прозвище или мирское имя, которое в древности давали человеку. В народной культуре жаворонок считался «божьей» птицей: по легендам, он приносил Богородице вести о Христе, утешал её и предсказывал Воскресение. Давая ребёнку имя Жайворон, родители верили, что природа примет его как своего и передаст ему лучшие качества этой чистой и звонкой птицы.

Суффикс -ко в фамилии — типичный украинский уменьшительный или патронимический формант. Он указывает на то, что предок носителя фамилии был сыном или потомком человека по прозвищу Жайворон. Такая модель словообразования широко распространена на Левобережной Украине и в южнорусских областях, граничащих с Украиной. Фамилии на -ко (Жайворонко, Соловейко, Голубенко) часто встречаются среди казачества и крестьянства, где прозвища от названий птиц были особенно популярны.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ев или -ин, украинская форма Жайворонко не склонялась по падежам как притяжательное прилагательное, что тоже выдает её региональное происхождение. Встречаются и родственные варианты: Жаворонков (русифицированная форма), Жаворонко, а также более редкие Жайворонок. Выбор именно формы с -ко может говорить о том, что предки носителя жили в центральных или восточных областях Украины, где такие окончания фамилий особенно типичны.