Фамилия Жемерина — женская форма, а мужская, Жемерин, образована по простой и распространённой модели: к основе добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын или потомок человека по прозвищу). Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Жемера.

Что такое «Жемера»? Скорее всего, это диалектное или профессиональное прозвище. В русских говорах слово «жемерить» означало «жадно есть», «уплетать», а «жемера» — обжора, ненасытный человек. Прозвища по манере еды были обычны в крестьянской среде: не ругательство, а бытовая характеристика, которая закреплялась за человеком и переходила к детям. Второй возможный корень — от «жемчуг» (в старом произношении «жемера» могло быть искажением или уменьшительной формой), но это менее вероятно: прозвища от «жемчуга» давали бы скорее по занятию (жемчужник) или по внешности.

Географически фамилия Жемерин встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях, где диалектное слово «жемера» было в ходу. Редкость фамилии (встречается нечасто) говорит о том, что прозвище не стало массовым, а закрепилось в одном-двух родах.

Социально носители фамилии — скорее всего, крестьяне или посадские люди. В дворянские роды с такой фамилией не попали, в списках служилых людей XVI–XVII веков она не отмечена. Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я, и не даёт подсказки о сословии: так могли называть и холопа, и вольного землепашца.

Если опираться на словарь русских фамилий (работы Б. Унбегауна, В. Никонова), Жемерин — яркий пример «вкусового» прозвища, где за бытовой чертой стоит живая речь прошлого. Фамилия не изменила формы, не получила дворянских приставок и осталась в том виде, в каком её записали в переписных книгах.