Фамилия Жемеров — один из тех случаев, когда за привычным славянским окончанием -ов стоит неочевидная основа. Если сразу отбросить версию о связи с драгоценными камнями (жемчуг здесь ни при чём), то остаётся два основных объяснения, и оба ведут на Украину.

Корень фамилии — прозвище Жемер. Его выводят из украинского слова «жемериння». В прямом значении это «шелуха», «выжимки» или «остатки после выжимания масла из семян масличных культур». Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, занимался производством или продажей растительного масла. Маслобойное ремесло было распространено в украинских сёлах и местечках, и отходы производства — жемериння — были характерной приметой такого хозяйства. Прозвище могли дать и тому, кто торговал жмыхом, и самому владельцу маслобойни.

Вторая версия отталкивается от переносного смысла того же слова. В говорах «жемериння» могло означать «вялый, бесхарактерный человек». Здесь прозвище указывает уже не на профессию, а на склад характера или манеру поведения — медлительного, пассивного человека могли прозвать Жемером по аналогии с никчёмными отходами.

Модель образования фамилии типична для восточнославянской традиции: суффикс -ов присоединился к основе прозвища, и потомки Жемера стали Жемеровыми. Встречаемость фамилии невысока, что подтверждает её узкое, локальное происхождение — скорее всего, из регионов традиционного маслоделия на Левобережной или Правобережной Украине. Какая из двух версий правдоподобнее? Первая, профессиональная, выглядит весомее: прозвища по роду занятий давали чаще, чем по случайной черте характера, и они лучше закреплялись в качестве фамилий.