Фамилия Жигуновская — одна из тех, что сразу отсылает к географии, а не к профессии или личному прозвищу. Её основа, суффикс и окончание указывают на то, что перед нами типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «название места + -ск(ий)». В русской ономастике такие фамилии чаще всего получали дворяне по названию своих поместий, а также духовенство при поступлении в семинарию — им нередко меняли фамилию на более благозвучную, «облагораживая» её с помощью суффикса -ский.

Корень здесь — «жигун» или «жигунок». Самое вероятное объяснение: прозвище Жигун (или фамилия Жигунов) было образовано от глагола «жигать» — в диалектах так называли того, кто жжёт, палит, например, угольщика или смолокура. В некоторых говорах «жигун» — это ещё и озорник, шалун, буквально «жгучий» человек. От этого прозвища возникла фамилия Жигунов, а от неё, в свою очередь, — притяжательное прилагательное Жигуновский (буквально «принадлежащий Жигунову»), которое затем закрепилось как фамилия в женском роде — Жигуновская.

Впрочем, есть и другая версия, более прозаичная: фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Жигуново, Жигуновка или даже от известных Жигулёвских гор. Форма Жигуновская (с ударением на втором слоге) встречается в документах XIX века у крестьян и мещан из центральных губерний России, особенно из районов, где были распространены фамилии на -ский у непривилегированных сословий. Так что, в отличие от многих дворянских фамилий этой модели, Жигуновская могла принадлежать и простому крестьянину, которого записали по месту жительства — из деревни Жигуново.

Интересная деталь: в отличие от фамилии Жигунов, которая встречается повсеместно, Жигуновская — редкая и более локальная. Её носительницы, скорее всего, происходят из одной или нескольких соседних деревень, где когда-то жили Жигуновы или стояло село с таким названием. Семинарское происхождение здесь маловероятно: в духовных училищах предпочитали более книжные и «цветистые» основы.