Фамилия Жигунина — женская форма от Жигунин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Жигуня. Самое интересное здесь — не основа, а суффиксальная модель. Фамилия на -ин, а не на -ов, что указывает на древний тип образования: такие фамилии чаще всего происходили от прозвищ, оканчивающихся на -а или -я (Жигуня, как Ваня, Петя). В ономастике это считается более архаичным пластом, чем фамилии на -ов/-ев, которые массово возникли позже, в XVI–XVII веках.

Основа фамилии — «жиг» или «жигу». В русских говорах слово «жиг» имело несколько значений. Самое распространённое — это «огонь», «жар», «пал» (от глагола «жечь»). Прозвище Жигуня могли дать человеку с горячим, вспыльчивым нравом, либо тому, кто работал с огнём: кузнецу, смолокуру, углежогу. В южнорусских и поволжских говорах «жигун» — это ещё и овод, слепень. В этом случае прозвище могло достаться назойливому, приставучему человеку. Менее вероятная, но возможная версия — связь с рекой Жигулёвкой или Жигулями, но тогда фамилия скорее звучала бы как Жигулёв или Жигулин.

Географически фамилия Жигунин встречается не повсеместно, а тяготеет к центральным и южным областям России: Тульская, Рязанская, Липецкая, а также Поволжье. Это не случайно — в этих краях слово «жиг» в значении «огонь» было в ходу у крестьян.

Социально носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянскому или посадскому сословию. Фамилии на -ин у крестьян закрепились в основном после отмены крепостного права в 1861 году, когда потребовалась массовая фиксация фамилий. До этого Жигунины могли быть известны по месту жительства или роду занятий — например, как семья кузнеца или смолокура.

Таким образом, фамилия Жигунина, при всей своей редкости, несёт чёткую смысловую нагрузку: она указывает либо на профессию, связанную с огнём, либо на характер — горячий, «жгучий» человек.