Фамилия Жижин — одна из тех, что построены по простой и понятной модели: к основе, прозвищу Жижа, добавили типичный русский фамильный суффикс -ин. Суффикс указывает на принадлежность: Жижин буквально значит «сын Жижи» или «человек из рода Жижи». Такая модель была особенно распространена в северных и центральных областях России.

Споров о том, что означало само прозвище Жижа, немного. Самая прямая версия отсылает к слову «жижа» — жидкая грязь, слякоть. Прозвище могли дать человеку, который жил в сырой низине или на болотистой почве. Такая привязка к месту жительства — частый случай в русской антропонимии.

Есть и другая версия, но она менее убедительна. В украинском языке слово «жижа» имеет значение «огонь». Если принять эту гипотезу, прозвище могло характеризовать вспыльчивого, горячего человека. Однако для центральнорусских и тульских земель, откуда происходят ранние документальные свидетельства о носителях фамилии, связь с «грязью» выглядит естественнее.

В исторических источниках фамилия встречается с первой половины XVII века. С. Б. Веселовский в своих ономастических работах упоминает Ивана Ивановича Жижу Плещеева (середина XVII века) — прозвище здесь уже выступает как родовое. Ещё раньше, в 1623 году, в Туле зафиксирован пушкарь Абрам Жижин. Эта запись ценна тем, что показывает: фамилию носил не боярин или помещик, а служилый человек по прибору — пушкарь, то есть представитель военно-ремесленного сословия.

Говорить о точном месте и времени возникновения фамилии Жижин сложно: фамилии на -ин складывались постепенно на протяжении нескольких столетий. Но ясно одно: прозвище Жижа, лёгшее в основу, было живым и употребительным в русской среде как минимум с начала XVII века.