Фамилия Жижинова — это отчество второго порядка, то есть она образовалась по цепочке: Жижа → Жижин → Жижинов. Иначе говоря, предок носителя фамилии был сыном Жижина и внуком человека по прозвищу Жижа. Такая модель с двойным суффиксом (-ин + -ов) встречается реже, чем простые отчества, и характерна для фамилий, которые закрепились в письменных источниках не сразу, а спустя поколение или два.

Основа фамилии — прозвище Жижа. В русских говорах «жижа» означала вязкую густую жидкость, а также жидкую часть похлебки или супа. Отсюда два основных объяснения: прозвище могли дать либо человеку, жившему в болотистой, сырой низине (по сходству с топкой местностью), либо повару, который постоянно имел дело с варевом. Вторая версия выводит Жижу из украинского «жижа» — «огонь». В этом случае прозвище указывало бы на горячий, вспыльчивый нрав.

Исторические примеры подтверждают, что прозвище бытовало в разных слоях общества. В словаре Веселовского упоминаются Иван Иванович Жижа Плещеев (середина XVII века) и Абрам Жижин, тульский пушкарь (1623 год). Эти записи показывают, что основа фамилии не была редкой и встречалась как в служилой, так и в посадской среде.

Фамилия Жижинова — женская форма, указывающая на принадлежность к роду Жижиновых. Мужской вариант — Жижинов. Географически фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России, что соответствует ареалу бытования прозвища Жижа.