Фамилия Жунусбеков — типичная для казахской и тюркской ономастики патронимическая фамилия, образованная по русской модели. Её основа — составное мужское имя Жунусбек, которое в свою очередь является фонетическим вариантом более распространённого имени Юнусбек. Переход начального «Ю» в «Жу» — характерная черта тюркского произношения, особенно в казахском языке, где звук «ж» часто замещает исконное «й» или «ю» в начале слова.

Разберём имя-основу. Первая часть, Юнус (или Жунус), восходит к арабскому имени пророка Ионы (Йунус), которое через древнееврейское «йона» означает «голубь». В мусульманской традиции пророк Юнус известен историей о пребывании в чреве кита, поэтому имя несёт религиозный и символический подтекст. Вторая часть — «бек» — древнетюркский титул, обозначающий «князь», «господин», «предводитель». В составе сложных имён «бек» указывал на знатное происхождение или высокое положение, а со временем стал просто престижным компонентом, означающим «господин» или «владыка».

Таким образом, имя Юнусбек (и его вариант Жунусбек) можно перевести как «господин-голубь» или «князь, подобный пророку Юнусу». Впрочем, в бытовом сознании носителей имени компонент «бек» чаще воспринимался не как самостоятельное значение, а как указатель на уважаемого человека.

Фамилия Жунусбеков построена по стандартной русской словообразовательной модели: к основе имени Жунусбек добавлен суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?»). Такой способ — самый распространённый для русификации фамилий народов Средней Азии и Кавказа в XIX–XX веках. Суффиксы -ский, -цкий, -енко, -ек, свойственные украинцам, белорусам и полякам, для этой фамилии нехарактерны: они встречаются реже и, как правило, в других регионах.

Кем могли быть предки? Скорее всего, основатель рода носил имя Жунусбек и был человеком уважаемым — возможно, старшиной, военным или духовным лицом. Фамилия не даёт точного указания на сословие, но её состав (с компонентом «бек») намекает на принадлежность к местной элите или к роду, который стремился подчеркнуть свою знатность. Географически фамилия встречается преимущественно у казахов, а также у киргизов и других тюркоязычных народов, где имя Юнус/Жунус популярно благодаря исламской традиции.