Фамилия Зубрин построена по простой и понятной модели: к основе «Зубр-» добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин. Этот суффикс указывает на родство: Зубрин — «сын Зубри» или «человек из рода Зубри». Вопрос в том, что скрывалось за этим прозвищем или мирским именем.

Самая неожиданная версия связывает имя Зубря с растением жабрей (Galeopsis tetrahit). В народе этот сорняк называют ещё «зубря» или «зября». Жабрей — живучий и ядовитый сорняк, который растёт где угодно. Давая ребёнку имя Зубря, родители могли желать ему такой же выносливости и умения постоять за себя, как у этого растения. Версия редкая, но имеет под собой словарную основу: в диалектах слово «зубря» действительно зафиксировано в значении «жабрей».

Есть и более привычное объяснение — от глагола «зубрить». У этого слова два значения: «делать зазубрины, точить» и «заучивать наизусть». Прозвище Зубря могли дать мастеру, который правил косы и серпы, — то есть профессиональному точильщику сельскохозяйственных орудий. В крестьянской среде такое занятие было востребованным, и прозвище легко закреплялось за человеком, а затем переходило к его детям как фамилия.

Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит прозвище от названия животного — зубра. Однако тогда фамилия скорее имела бы форму Зубров (с суффиксом -ов), а не Зубрин. Суффикс -ин обычно присоединяется к основам на -а/-я: Зубря → Зубрин. Поэтому версия с растением или глаголом выглядит грамматически более убедительной.