Фамилия Абаркина — женская форма фамилии Абаркин, а та в свою очередь образована от прозвища Абарка. Разбирать её стоит с основы и суффикса: типичный для русских фамилий суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Абаркин, то есть сын или потомок Абарки). Само прозвище Абарка — короткое, ёмкое, и его происхождение спорно, но все версии укладываются в логику бытовых или этнических прозвищ Древней Руси.

Самая надёжная версия ведёт Абарку к диалектному рязанскому слову «обарка» — гороховая похлёбка или разварной горох. Прозвище могли дать человеку, который любил или часто готовил это блюдо, либо тому, кто торговал им. Близкая по смыслу версия связывает прозвище со словом «обара» — опара, тесто. В таком случае Абаркой называли пекаря: характерный признак профессии легко переходил в уличное прозвище. Оба варианта объединяет кулинарно-бытовая среда, что типично для русских фамилий, возникших в крестьянской или ремесленной среде.

Менее распространённая, но не лишённая оснований гипотеза отсылает к этнониму «абары» — так в древних сирийских и некоторых других источниках именовали представителей хазарских и булгарских родов. Если принять эту версию, прозвище Абарка отражало этническую принадлежность предка: его могли так прозвать за внешность, язык или обычаи, напоминавшие потомкам о степных корнях. Однако эта версия слабее бытовых: прямых письменных подтверждений бытования такого прозвища в русских землях нет, и она остаётся гипотетической.

Фамилия Абаркина встречается редко, что тоже косвенно говорит в пользу первого, диалектного объяснения: локальное слово «обарка» (с характерным аканьем, давшим написание Абарка) не вышло за пределы рязанского говора, поэтому и число носителей невелико. Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям, где акающий говор был нормой. В написании фамилии сохранилась начальная «А» вместо исконной «О» — это фонетический след, закреплённый в документах.