Фамилия Абарюс — редкий случай, когда мы с высокой вероятностью можем говорить о литовском или жемайтском происхождении. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые оканчиваются на -ов, -ин или -ский, окончание -юс (как и -ис, -ас) прямо указывает на литовскую языковую основу. В Литве и исторических землях Великого княжества Литовского такие фамилии были распространены у крестьян и мелкой шляхты, особенно после реформы 1930-х годов, когда литовцам массово заменили славянские окончания на национальные. Абарюс — это не русифицированная, а именно литовская форма.

Основа фамилии, скорее всего, восходит к литовскому слову abaras или abartas — «ссора», «раздор» или «перебранка». Соответственно, Абарюс могло быть прозвищем сварливого, неуживчивого человека. В литовской ономастике суффикс -юс часто образует фамилии от прозвищ или личных имён, указывая на принадлежность к роду. Менее вероятная, но возможная версия — связь с личным именем Абрахас (литовская форма Авраама), где произошло упрощение: Абраюс → Абарюс. Однако первая версия, с корнем «ссора», встречается в литовских фамильных словарях чаще и объясняет смысл прозвища без натяжек.

Географически фамилия Абарюс практически не встречается за пределами Литвы и пограничных районов Беларуси и Польши, входивших в Речь Посполитую. В русских переписных книгах её нет — это не крестьянская фамилия центральной России и не дворянская из «Бархатной книги». Носители Абарюс, если они жили на территории Российской империи, скорее всего, были литовцами-католиками, и фамилию фиксировали в метрических книгах костёлов. В советское время, при паспортизации, её могли записать без изменений, так как окончание не требовало русификации.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком: в ней нет русского суффикса принадлежности. Это не «Абарюсов» и не «Абарюсин» — это прямая литовская форма, которую в русском языке склоняют по правилам мужского рода (Абарюса, Абарюсу), хотя в оригинале она относится к типу склонения на -ис/-юс. Такие фамилии — живые свидетели балтийского субстрата в восточноевропейской антропонимике, и их носители, как правило, могут проследить корни до конкретного региона Литвы.