Фамилия Абайдулаева — женская форма, образованная от мужской Абайдулаев, и её происхождение напрямую связано с арабским именем Абайдулла. Это составное имя переводится как «маленький раб Аллаха» или «слуга Всевышнего»: основа «абд» означает «раб, слуга», а «Аллах» — «Бог». Уменьшительная форма «Абайд» вместо «Абд» — характерная черта тюркских языков, где строгие религиозные имена на бытовом уровне смягчались, приобретая ласковый оттенок. Именно этот вариант и лёг в основу фамилии, что сразу отличает её от более формальных аналогов вроде Абдуллаева.

Фамилия сложилась по стандартной для тюркских народов модели: к имени Абайдулла добавили русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). В XIX — начале XX века так фиксировали фамилии у мусульманских народов Российской империи — чаще всего у татар, башкир, азербайджанцев и народов Северного Кавказа. Суффикс указывает на принадлежность к роду: Абайдулаевы — это потомки человека по имени Абайдулла. Интересно, что в русских документах того времени встречается написание «Абайдулаевъ» через «о», что отражает акающее произношение, свойственное многим тюркским говорам.

Географически фамилия распространена в Поволжье, на Урале, в Закавказье и среди кавказских народов. Встречается она и у казахов, хотя у них более типична форма Абайдуллаев или Абайдуллин. Сословно предки носителей чаще всего были крестьянами или мещанами, реже — служилыми татарами или муллами. Имя Абайдулла нередко давали в семьях, где хотели подчеркнуть религиозное благочестие, но при этом использовали домашнюю, ласковую форму. Так что фамилия несёт отпечаток народного ислама, где арабские имена адаптировались под местный быт.

Редкий вариант написания — Абайдулаев с одним «л» — встречается в некоторых регионах как результат упрощения двойной согласной в живой речи, но в официальных записях преобладает двойное «л», соответствующее исходному имени.