Фамилия Абдугапаров — классический пример того, как русская словообразовательная модель наложилась на арабо-тюркское имя. В основе лежит мужское имя Абдугапар, которое, в свою очередь, является вариантом имени Абдуль-Гафур. Корень здесь — арабское «абд» (раб, слуга) в сочетании с «аль-Гафур» (Всепрощающий — один из эпитетов Аллаха). Полное значение — «раб Всепрощающего», что типично для мусульманских теофорных имён, образованных по схеме «абд + один из 99 имён Бога».

Фамилию создали по стандартной русской модели: к основе Абдугапар добавили патронимический суффикс -ов, который в славянской традиции означал «сын такого-то». То есть Абдугапаров буквально — «сын Абдугапара». Это указывает на то, что предок носителя фамилии носил имя Абдугапар, и фамилия закрепилась за его потомками в тот период, когда у тюркских народов, исповедующих ислам, начали массово появляться фамилии — обычно в конце XIX — начале XX века.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где сильно влияние ислама и тюркских языков: Узбекистан, Казахстан, Киргизия, Таджикистан, а также некоторые республики России (например, Татарстан, Башкортостан). Встречается и вариант Абдугафаров, где «п» заменяется на «ф» — это ближе к арабскому произношению имени Аль-Гафур, но в тюркской среде звук «п» часто вытесняет «ф» из-за особенностей фонетики.

С точки зрения социальной истории, фамилия не несёт следов дворянского или купеческого происхождения. Она типична для крестьянских и ремесленных слоёв, у которых фамилии образовывались от имён отцов. Никакого прозвища или ремесла в основе нет — только религиозное имя, данное при рождении. Поэтому искать в ней указание на профессию предка не стоит.

Редкость фамилии в том, что она сохранила не самый распространённый вариант имени. Встречаются более частые Абдуллаевы, Абдурахмановы, Абдулхаковы. А вот Абдугапаров — более локальная форма, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если человек с такой фамилией живёт, скажем, в России, его корни почти наверняка ведут в Среднюю Азию, а не в арабский мир.