Фамилия Абдыгаппаров — одна из тех, где основу легче понять, если смотреть не на русский, а на тюркский корень. Она образована от мужского имени Абдыгаппар, которое восходит к арабскому «Абд аль-Гаффар» — «раб Прощающего», то есть слуга Аллаха (эпитет «аль-Гаффар» означает «Всепрощающий»). В исламской традиции такие имена с компонентом «абд» (раб) и одним из 99 имён Бога очень распространены. Русский суффикс -ов добавился уже при адаптации фамилии в документах Российской империи или СССР, типично для тюркских фамилий, оформленных по русской модели.

Географически фамилия Абдыгаппаров почти наверняка казахская или киргизская. В Казахстане и Киргизии имя Абдыгаппар встречается нередко, а фамилии на -ов там стандартно давали по отцу. Встречается она и у каракалпаков, реже — у узбеков. Русские переписчики в XIX веке часто записывали такие длинные арабские имена на слух, поэтому возможны варианты вроде Абдыгапаров или Абдыгаппаров, но двойное «п» в середине — показатель точной передачи арабского удвоения согласного.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий, где суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?»), здесь он присоединён к полному имени, а не к прозвищу. Это значит, что предок носителя, скорее всего, не имел другого, более древнего родового имени — фамилию ему дали по отцу, которого звали Абдыгаппар. В казахской степи такие фамилии начали массово закрепляться после 1860-х годов, когда Российская империя ввела переписи населения.

Однокоренные фамилии — Абдыгаппаров, Абдыгапаров, Абдулгаппаров — все от одного корня, но с разной степенью русификации. Если встретите вариант без начального «А» (Габдулгаппаров), это татарская или башкирская огласовка того же имени. Споров о происхождении нет: основа прозрачная, а суффикс — стандартный для региона.