Фамилия Аболкин образована от прозвища или нецерковного имени Аболка. В основе лежит древнерусское слово «оболокать» — одевать, покрывать, или же имя Аболка как производная форма от канонического имени Аполлон. Первый вариант выглядит правдоподобнее: Аболкой могли прозвать портного, скорняка или человека, который носил особую, заметную одежду. Суффикс -ин в окончании фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — сын Аболки. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где патронимические фамилии на -ин вытесняли более южные формы на -ов.

В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с именем Аболка, но фамилия Аболкин фиксируется позже, в переписях XVIII–XIX веков. Географически она тяготеет к Вятке, Пермской губернии и Поволжью — регионам, где активно селились старообрядцы и государственные крестьяне. В этих местах прозвища, связанные с бытом и ремеслом, закреплялись как фамилии особенно прочно.

Редкость фамилии объясняется тем, что исходное имя Аболка почти вышло из употребления к концу XVIII века, уступив место полным церковным формам. Поэтому Аболкины — не многочисленный, но устойчивый род, чьи предки с высокой вероятностью занимались шитьём, выделкой кож или торговлей сукном. Никаких дворянских ветвей или известных исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано — это фамилия простых людей, ремесленников и крестьян.