Фамилия Абубекирова образована от мусульманского мужского имени Абубекир – варианта имени Абубакир, которое в своей основе имеет два элемента: именной компонент «абу» и компонент «бекир» - вариант имени Бакер. Именной компонент «абу» - вариант компонента «абель», которое восходит к арабскому слову «аб», имеющему значения «отец ребенка; основной, истинный владелец». Имя Бакер в переводе с арабского означает «верблюжонок», «молодой, чистый, целомудренный». Имя Абубекир переводится на русский как «воплощение чистоты», «отец чистоты». Таким образом, потомок человека, которого звали Абубекир, со временем получил фамилию Абубекиров.