Фамилия Абукаева относится к распространённому на Кавказе типу фамилий, образованных от личного имени. В её основе лежит мужское имя Абука, которое представляет собой уменьшительно-ласкательную или обиходную форму от арабского имени Абубакар (или Абу Бакр). Имя Абу Бакр означает «отец девственницы» и принадлежало первому праведному халифу, сподвижнику пророка Мухаммеда, что делает его особенно почитаемым в исламе. Таким образом, фамилия буквально означает «принадлежащий Абуке», то есть потомок человека, носившего это имя.

Словообразовательная модель фамилии — русский суффикс принадлежности -ев, добавленный к основе Абукай- (в именительном падеже Абука, в косвенных Абукай). Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или й. Такое оформление характерно для фамилий, возникших в среде, где русское делопроизводство фиксировало имена иноязычного происхождения по стандартной схеме: имя отца плюс суффикс.

Географически фамилия Абукаева наиболее типична для народов Северного Кавказа, в первую очередь для чеченцев и ингушей. У вайнахских народов имя Абука (иногда в форме Абук) встречается как самостоятельное, а фамилии с таким корнем — одни из самых узнаваемых. Встречается она и у кумыков, аварцев, а также у других народов Дагестана, что объясняется общим ареалом распространения ислама и схожими антропонимическими традициями.

Интересно, что, в отличие от многих русских фамилий, которые могли происходить от прозвищ по роду занятий или внешности, Абукаева — чисто патронимическая, то есть восходящая напрямую к имени предка. Это говорит о том, что основатель рода был, скорее всего, уважаемым человеком, которого называли по имени, а не по профессии или месту жительства. Других версий происхождения, например от тюркских корней со значением «отец» или «дед», ономастика не предлагает, так как вайнахская основа здесь очевидна и не требует альтернатив.

Женская форма фамилии — Абукаева — не склоняется по падежам, если принадлежит женщине, а мужская — Абукаев — склоняется как обычное притяжательное прилагательное. В дореволюционных записях фамилия могла фиксироваться с окончанием -ев или, реже, -ов, но современное написание устоялось именно с мягким вариантом.