Фамилия Абыкеева — женская форма, образованная от мужской Абыкеев. В её основе лежит имя или прозвище Абыкей, хорошо знакомое в тюркоязычной среде. Скорее всего, оно восходит к тюркскому слову «абы» или «аба» — старший брат, уважаемый человек, наставник. В некоторых диалектах «абыкей» служило почтительным обращением к старшему родственнику или духовному лицу. Значит, фамилия указывает на родоначальника, которого окружающие называли Абыкеем — то есть уважаемым и старшим.

Модель образования типична для фамилий тюркского происхождения, которые вошли в русскую ономастику: к основе добавляется русский патронимический суффикс -ев (фонетически закономерный после мягкого согласного). Окончание -а указывает на принадлежность женщине. Примечательно, что фамилия сохранила тюркскую огласовку без русификации: начальное «А» не перешло в «О», как нередко случалось в обрусевших фамилиях (сравните с Абакумов — Обаконов). Это говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где тюркский язык сохранял своё влияние.

Географически фамилия Абыкеева тяготеет к регионам с тюркским населением — Поволжью, Уралу, Сибири. Чаще всего её встречают у татар, башкир, казахов и киргизов. В документах XIX века такая фамилия могла закрепиться за крестьянами или мещанами, но без точных архивных данных это лишь предположение. Споров о происхождении основы почти нет: версия с «абы» — старший брат — считается основной. Альтернативное толкование от арабского «аби» (отец) менее вероятно, ведь в тюркских языках это слово дало бы форму Абикеев, а не Абыкеев. Так что корень у фамилии прозрачный, и её носительницам легко объяснить значение своей фамилии без оглядки на сложные гипотезы.